深圳市市场监管局于11月30日上午组织执法力量全城联动、多点出击，对深圳34家吉野家门店开展全覆盖现场突击检查。执法人员检查过程中发现，有10家吉野家门店存在厨房地面积油积水、三防设施不全、半成品标签标识不全等问题。其中，5家门店的违规情形轻微，已责令现场完成整改；3家门店存在未按法规要求储存食品、建立台账等问题，已现场开具整改通知书，责令限期整改。另有2家门店涉嫌其他违法违规行为，其中一家门店涉嫌使用无标签标识的炸鸡腌料，已立案调查；另一家门店用于油炸的食用油涉嫌未按法规要求及时更换，待食用油检测结果出炉后，将确定是否立案调查。后续食品抽检及处理情况，深圳市市场监管局将持续通报。
11月29日，被称为餐饮行业“公敌”的“内幕纠查局”在最新一期卧底调查节目中，直指吉野家用“变酸发臭肉、过期蔬菜和黑质油”，吉野家是老牌企业，一旦出现安全问题，就能引起消费者广泛关注。
通过暗访视频可以发现，吉野家将过期的蔬菜直接上给了顾客，与垃圾桶直接接触的量杯被工作人员随手扔进汤锅，随处可见已过最佳食用时间的肉块和多次使用已经严重发黑的油。一款网红产品麻婆豆腐的肉沫透着一股酸臭味，另一款网红产品寿喜锅中的巴沙鱼是发臭的。
11月29日晚，认证名称为北京吉野家快餐有限公司的“吉野家官方微博”发布声明称，吉野家在中国市场分属不同的运营公司，北京、天津、河北、河南、内蒙、东北三省的吉野家由合兴餐饮集团运营，曝光视频中的吉野家餐厅并不在该公司运营范围内。涉事餐厅并不在合兴餐饮集团运营范围内，并表示会在其运营范围内开展自查工作。
吉野家是日本快餐界的头部品牌之一，已超过百年历史。1992年，日本吉野家在北京王府井开出中国首店之后，吉野家慢慢地“分家”了，逐渐演化成南北两个阵营，其中南方系的经营权归属吉野家日本总部，采取直营形式，2020年吉野家官宣关闭的50家中国门店，属于这家公司。北方系的的经营权归属具有港资背景的合兴集团。
吉野家（中国）投资有限公司成立于2015年6月，由株式会社吉野家集团全资控股，公司表示，涉事门店属安徽地区，已被停业整顿。并且成立了紧急品质管理专项组进行调查，同时开展吉野家各家门店的品质检查。
而这一次深圳突查的34家吉野家，还是存在许多问题，并不经得起检查。
涉事门店为安徽省区域的，确实不在合兴集团运营范围内，但合兴集团声明后，网友却不买账，被认为是“甩锅式”声明，合兴集团则很难解释得清楚。
吉野家两个运营主体共享一个品牌，在发展上存在很大问题，食品安全被曝光后，受伤的是全部门店。